Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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