Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms