Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms