Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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