Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CSNK2A3Q8NEV1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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