Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms