Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms