Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms