Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTROBQ8N137 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms