Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms