Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLRP9Q7RTR0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLRP9Q7RTR0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLRP9Q7RTR0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLRP9Q7RTR0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLRP9Q7RTR0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms