Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDZRN4Q6ZMN7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms