Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINGO4Q6UY18 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINGO4Q6UY18 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms