Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG9

LRFN4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN4Q6PJG9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms