Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms