Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms