Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM29Q5VYK3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms