Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms