Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms