Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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CFAP100Q494V2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms