Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms