Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
P3H1Q32P28 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P3H1Q32P28 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms