Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNOP1Q1ED39 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms