Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms