Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NTRK3Q16288 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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