Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETFDHQ16134 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms