Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms