Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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