Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
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