Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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