Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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