Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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