Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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