Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms