Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TLR1Q15399 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms