Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms