Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF1Q15361 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF1Q15361 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TTF1Q15361 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TTF1Q15361 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF1Q15361 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTF1Q15361 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TTF1Q15361 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTF1Q15361 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TTF1Q15361 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF1Q15361 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTF1Q15361 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTF1Q15361 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTF1Q15361 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TTF1Q15361 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF1Q15361 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF1Q15361 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF1Q15361 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF1Q15361 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF1Q15361 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF1Q15361 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF1Q15361 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF1Q15361 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTF1Q15361 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF1Q15361 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTF1Q15361 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF1Q15361 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.28■■□□□ 1
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