Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms