Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SMCO1Q147U7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SMCO1Q147U7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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