Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE7AQ13946 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7AQ13946 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms