Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR3Q13615 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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