Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
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