Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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