Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms