Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms