Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC6Q03468 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms