Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB1Q02818 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms