Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPCQ01831 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPCQ01831 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPCQ01831 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPCQ01831 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPCQ01831 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPCQ01831 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPCQ01831 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPCQ01831 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPCQ01831 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPCQ01831 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPCQ01831 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPCQ01831 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
XPCQ01831 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPCQ01831 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPCQ01831 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPCQ01831 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPCQ01831 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPCQ01831 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
XPCQ01831 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
XPCQ01831 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPCQ01831 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPCQ01831 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPCQ01831 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPCQ01831 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPCQ01831 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPCQ01831 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPCQ01831 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPCQ01831 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPCQ01831 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPCQ01831 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPCQ01831 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPCQ01831 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
XPCQ01831 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPCQ01831 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPCQ01831 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPCQ01831 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPCQ01831 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPCQ01831 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPCQ01831 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPCQ01831 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPCQ01831 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms