Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms