Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms